《合金装备5：幻痛》预告片剧情视频+图文解析

　　随后而来的是2004年发售的MGS3，讲述了Naked Snake，也就是Solid Snake的克隆源、日后的Big Boss，孤身潜入苏联、破坏核搭载战车Shagohod并被迫亲手杀害恩师The Boss的故事。

　　2008年发售的MGS4是对Solid Snake故事的终结，破坏了爱国者AI的他被Big Boss拯救于自杀、杀死了幕后黑手Zero的Big Boss最终也死于FoxDie病毒。

　　承接3代故事的掌机作品和平行者于2010年发售，Big Boss得以建立属于自己的军队、在已亡恩师The Boss的AI的帮助下再次拯救世界于核战争、破坏了机体和平行者。随着自己军队科技的进步，Big Boss也拥有了自己的机体Metal Gear ZEKE。