在最终关,玩家控制的角色被外星人掳走,被迫切换成别的角色开小火箭上宇宙营救,然后全军燃的不行地攻入外星人母舰。伴随着章鱼大Boss火星之根(Rootmars)坠海,长久以来和火星章鱼的战斗也在此画上了完满的句号。同时画上句号的,还有SNK。因财政问题,SNK推出《合金弹头3》后不久便宣布破产,担任2、X、3代画师的森气楼也离开SNK转投CAPCOM。
至于后来的4代和5代,平心而论只能算是外传性质的作品,无论剧情设定还是制作水准都和1、2(X)、3代有着巨大的差异,直到《合金弹头6》才再次延续3代主线故事。火星章鱼大败后元气大伤,希望回到往日的辉煌,而莫登元帅又一次想和曾经背叛过他的火星人合作,于是一拍即合结成同盟。他们第一步是复活葬身海底的火星之根,希望借助其强大的力量统治地球。然而由于以火星人为食的金星人乱入,莫登和火星人乱了阵脚,因此以俘虏为条件,要求正规军与他们合作,一同赶走这个棘手的敌人,结果昔日敌人联合起来帮助火星之根重建文明灭了金星人,剧情可谓峰回路转。
最后来到《合金弹头7》,不死心的莫登元帅又一次作死,在垃圾岛建立起基地,当然马上被正规军摆平。这时候突然出现了时空裂缝,另一个时空的黑恶势力——莫登军团登场。最终决战是在火山口和一只机械章鱼打,胜利后眼看章鱼要沉到滚烫的岩浆中,幸好正规军的运输直升机及时赶到,把包括莫登在内的所有人救出火海。在这最后关头,火星人开来飞碟,莫登元帅和小兵又双叒叕一次逃掉了……
时至今天,尽管《合金弹头》人气已经不像往日那么火爆,但我相信仍然有不少喜欢合金的玩家,偶尔会通过模拟器等各种平台回味一番,毕竟原汁原味的街机已经相当罕见,而牛逼的射击和逗逼的故事都是那么的令人怀念。如果你爱折腾,也不妨搞个街机摇杆来,或许找回童年时光就是这么简单。